Simulan la evolución de órganos complejos en 3D por vez primera محاكاة تطوُّر أعضاء معقّدة ثلاثيّة الأبعاد: للمرّة الأولى Simulating the evolution of complex organs in 3D for the first time - <center> Fénix Traducción فينيق ترجمة Phoenix Translation </center> Fénix Traducción فينيق ترجمة Phoenix Translation : Simulan la evolución de órganos complejos en 3D por vez primera محاكاة تطوُّر أعضاء معقّدة ثلاثيّة الأبعاد: للمرّة الأولى Simulating the evolution of complex organs in 3D for the first time

2014-03-14

Simulan la evolución de órganos complejos en 3D por vez primera محاكاة تطوُّر أعضاء معقّدة ثلاثيّة الأبعاد: للمرّة الأولى Simulating the evolution of complex organs in 3D for the first time

Científicos de la UAB han comprobado que no todos los aspectos de la forma del cuerpo son igual de importantes en el proceso

Científicos de la Universidad Autónoma de Barcelona han logrado simular por primera vez la evolución de órganos complejos de forma tridimensional. Gracias a ello han podido evaluar mejor cómo funciona la selección natural sobre los distintos aspectos de la forma del cuerpo, y han comprobado que no todos estos aspectos son igualmente importantes en el proceso.

Investigadores de la Universidad Autónoma de Barcelona y de la Universidad de Helsinki (Finlandia) han logrado simular por primera vez la evolución de órganos complejos de forma tridimensional, integrando los mecanismos de regulación genética que se dan durante el desarrollo embrionario.

El trabajo, publicado en Nature, permite tener en cuenta la complejidad real de las interacciones genéticas que dan lugar a la forma adulta de los organismos, entender mejor cómo actúa la selección natural sobre los diferentes aspectos de la forma del cuerpo y hacer experimentos virtuales de evolución mucho más realistas.

“En la actualidad tenemos mucha información sobre qué cambios en qué genes dan lugar a qué cambios en la forma. Pero esto es meramente descriptivo. La cuestión es entender la lógica biológica que determina qué cambios en la forma aparecen por qué cambios en los genes y de qué forma puede cambiar el cuerpo”, explica en la nota de prensa de la UAB Isaac Salazar, investigador de la Universidad de Helsinki y del Departamento de Genética y Microbiología de la Universidad Autónoma de Barcelona y primer autor del artículo.

En la naturaleza esto viene determinado por el desarrollo embrionario, durante la vida de cada organismo, y por la evolución por selección natural, para cada población y especie. Pero en el campo de la evolución de los organismos es prácticamente imposible plantear experimentos, dada la gran escala temporal en la que se dan estos fenómenos. Esto hace que aún existan debates abiertos con hipótesis difíciles de demostrar experimentalmente. Esta dificultad se compensa con el uso de modelos teóricos para integrar detalladamente los datos experimentales existentes, simulando así la evolución virtualmente.

En su trabajo los investigadores han utilizado un modelo teórico basado en experimentos en desarrollo embrionario, basado en otro trabajo previo de los mismos autores también publicado en Nature (Salazar-Ciudad y Jernvall, 2010), y tres modelos matemáticos diferentes de evolución virtual por selección natural sobre la forma.

La evolución ocurre virtualmente en el ordenador en poblaciones de individuos en las que cada individuo puede mutar sus genes, justo como en la naturaleza. Éstas, mediante el modelo de desarrollo, producen nuevas morfologías y la selección natural decide cuáles pasan a la siguiente generación. Repitiendo este proceso en cada generación se puede ver la evolución en acción en el ordenador.

La simulación realizada ahora ha permitido comparar las diferentes hipótesis existentes en el campo de la evolución sobre qué aspectos de la morfología evolucionan más fácilmente: La primera visión es que todos los aspectos métricos de la forma contribuyen a la adaptación y que, consecuentemente, todos son moldeados por la evolución de forma fina a lo largo del tiempo.

La segunda visión es que algunos aspectos de la forma tienen un valor adaptativo más importante y que el resto cambia en la evolución como efectos colaterales a los cambios en los primeros. La tercera es que ningún aspecto de la forma es intrínsecamente más importante, sino que lo que es importante adaptativamente es una medida compleja de la rugosidad de la forma.

Conclusiones

“Lo que hemos encontrado es que la primera hipótesis no es posible y que la segunda lo es en algunos casos. Aunque la ecología favoreciese este tipo de selección (la primera visión), el desarrollo embrionario y la relación entre variación genética y morfológica que éste impone es demasiado compleja para que cada aspecto de la morfología haya sido moldeado finamente.

En cierta manera, lo que vemos que la selección natural está constantemente moldeando la forma de los cuerpos, pero que éstos distan mucho ser óptimos en muchos de sus aspectos”, comenta Salazar.

El trabajo ha sido liderado por Isaac Salazar-Ciudad y ha contado con la participación de Miquel Marín Riera, investigador en formación en la UAB. Parte del mismo se ha realizado en la comunidad de “evo-devo” (evolución y desarrollo embrionario) en el Instituto de Biotecnología de la Universidad de Helsinki y otra en el Grupo de Investigación de Genómica, Bioinformática y Evolución de la UAB.

Referencia bibliográfica:

Isaac Salazar-Ciudad y Miquel Marín-Riera. Adaptative dynamics under development-based genotype-phenotype maps. Nature (2013). DOI: 10.1038/nature12142.

 

 
حقَّقَ أخصائيُّون بجامعة برشلونة المستقلة محاكاة لتطوُّر أجهزة / أعضاء معقدة ثلاثيّة الأبعاد للمرة الأولى. وبناء عليه، تمكنوا من إجراء تقييم أفضل لكيفية عمل الإنتقاء الطبيعي على الملامح المختلفة بشكل الجسم، وقد تحققوا بأنّه ليست كل تلك الملامح بذات الأهميّة في هذه العملية.

شارك باحثون من جامعة برشلونة المستقلة مع زملاء لهم بجامعة هلسنكي / فنلندا بالعمل، حيث تمكنوا من تحقيق محاكاة ثلاثية أبعاد لتطوُّر أعضاء معقدة، وعملوا على دمج آليات تنظيم جيني تُعطى خلال النمو الجنيني.

يسمح هذا البحث المنشور بمجلة الطبيعة بأخذ التعقيد الواقعيّ بالتفاعلات الجينية بالحسبان، التي تفضي لمرحلة بلوغ الأعضاء، وتحقيق فهم أفضل لكيفية عمل الإنتقاء الطبيعي على الملامح المختلفة بشكل الجسم، إضافة لتحقيق إختبارات إفتراضية أكثر واقعيّة عن التطوُّر.

يشرح الباحث إيزاك سالازار من مكتب علم الوراثة وعلم الأحياء الدقيقة بجامعة هيلسنكي وجامعة برشلونة المستقلة والمسؤول الأوّل عن البحث، قائلاً:

"لدينا، بالوقت الراهن، معلومات كثيرة حول أيّ تغيّرات وبأيّ جينات، ستحقق تغيرات في الشكل. لكن، هذا الأمر وصفيّ بصورة كاملة. تكمن القضيّة بفهم المنطق البيولوجيّ المُحدِّد لأيّ تغيرات في الشكل ستظهر، بناء على حدوث تغيرات بالجينات، وبالتالي، ظهور تغيُّر بالجسم".

يتحدّد هذا في الطبيعة من خلال النموّ الجنينيّ، خلال حياة كل كائن حيّ، وعبر التطور من خلال الإنتقاء الطبيعي في حضن كل جماعة ونوع حيّ. 
 
لكن، في حقل تطور الكائنات الحيّة، يستحيل، عمليا، تحقيق إختبارات ميدانية نظراً للمدة الزمنية التي تستغرقها هذه الظاهرة. وهذا ما يجعل النقاش مفتوحاً على فرضيات صعبة لإثبات التطور تجريبياً. تجري مواجهة هذه الصعوبات عبر نماذج نظرية، تعتمد على معطيات اختبارية قائمة، ومن خلال محاكاة التطوُّر إفتراضياً.

استعمل الباحثون نموذجاً نظرياً مؤسساً على اختبارات بمرحلة النموّ الجنينيّ في عملهم، وكذلك، مؤسساً على بحث سابق لذات الباحثين ومنشور بمجلة الطبيعة العام 2010، إضافة لثلاثة نماذج رياضياتية مختلفة للتطور الإفتراضي عبر الإنتقاء الطبيعي حول الشكل.

يحصل التطوُّر إفتراضياً (حاسوبياً) بجماعات مكونة من أفراد، يمكن تحقيق طفرات بجينات كل فرد، كما يحصل في الطبيعة. ينتج عن تلك الطفرات، خلال نموذج النموّ، مورفولوجيات جديدة، وسيقرر الإنتقاء الطبيعي أيُّها سيعبر نحو الجيل التالي. بتكرار هذه العملية بكل جيل، يمكن رؤية التطوُر الحاصل في الحاسوب.

لقد سمحت عملية المحاكاة هذه بالمقارنة بين فرضيات مختلفة قائمة في حقل التطوُّر حول أيّ ملامح في المورفولوجيا تتطوّر بسهولة أكثر:

تتركّز الرؤية الأوليّة على إسهام كل الملامح القياسيّة (طول وعرض .. الخ) بالشكل في التكيُّف، وكنتيجة، تُصاغ كلها عبر التطوُّر بشكل نهائيّ بمرور الزمن.

تتركّز الرؤية الثانية حول إمتلاك بعض ملامح الشكل لقيمة تكيفية أهمّ، ويتغيّر الباقي منها في التطوُّر كآثار جانبية للتغيُّرات الأولى.

تتركز الرؤية الثالثة على إعتبار أنّه ولا ملمح في الشكل هو أهمّ، بل الأهم تكيفياً، هو درجة التعقيد بخشونة الشكل.

الخلاصة

ما اكتشفناه هو أنّ الفرضيّة الأولى غير ممكنة، وأن الفرضية الثانية غير ممكنة ببعض الأحوال. بالرغم من تفضيل علم البيئة لهذا النوع من الإنتقاء (الرؤية الأولى)، فإنّ النمو الجنيني والعلاقة بين التنوُّع الجيني والمورفولوجيّ هو أكثر تعقيداً لكي يُصاغ كل ملمح موروفولوجياً بصورة نهائية.

بصورة ملموسة، ما نراه هو أنّ الإنتقاء الطبيعي يصوغ شكل الأجسام دوماً، لكن، ستبقى بعيدة عن إحراز الشروط المثلى في الكثير من ملامحها.

ليست هناك تعليقات: